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[2025 최신/입법예고] 조세특례제한법 일부개정안 전부 정리 — 변경 전/변경 후 비교표 + 실무 체크리스트

Gatchi(같치) 2025. 8. 9. 09:58
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기획재정부가 2025년 8월 1일에 「조세특례제한법」 일부개정안을 입법예고(예고기간: 2025.08.01.~08.14.) 했습니다. 핵심은 △중소기업·벤처 투자 세제지원 확대/조정지역균형·민생 지원 강화PF·리츠 과세이연 신설고용세제 구조 개편 등입니다. 본 글은 공식 공고문·세제개편안 원문을 바탕으로 변경사항을 **항목별 ‘변경 전 ↔ 변경 후’**로 깔끔히 정리하고, 건설·제조·콘텐츠·벤처투자 실무에 바로 쓰는 체크리스트까지 제공합니다.

■ 법적 근거

  • 「행정절차법」 제42조(입법예고) 근거로 예고, 국민참여입법센터에서 의견 제출(마감 2025.08.14.). LeekoNTS Call
  • 기재부 입법예고 게시: 공고 제2025-154호·개정안 원문(HWPX) 첨부. 기획재정부
  • 현행 「조세특례제한법」 원문·시행령/규칙은 국가법령정보센터에서 확인. 국가법령정보센터국가법령정보센터

■ 1. 유사 포스팅 대비 보완 포인트

다수 요약글이 보도자료만 인용하거나 ‘연장’ 위주로 뭉뚱그립니다. 본 글은 입법예고 원문 조항별 문구현행법 조문/일몰 시한을 대조해 **‘변경 전 기준 → 변경 후’**를 명확히 표기하고 시행·적용시기, 실무 영향까지 정리했습니다. 영상콘텐츠 공제율, 고향사랑기부금 공제율, 고용세제 구조개편, 프로젝트 리츠 현물출자 과세이연 신설민감 항목은 원문·카드뉴스·세무법인 뉴스플래시까지 크로스체크했습니다. 기획재정부+1PwC


■ 2. 법적 근거 & 최신 동향(필수)


■ 3. 총괄 비교표(핵심 20선) — 변경 전 ↔ 변경 후 + 적용·영향

표는 핵심만 우선 제시합니다(세부 항목은 아래 각론).

구분 변경 전 변경 후(안) 적용/시행 실무 영향 근거

구분 변경 전 변경 후(안) 적용/시행 실무 영향 근거
생계형 창업중소기업 총수입 기준 8천만원 1억 400만원(부가세 간이과세 기준과 정합) 법 개정 후 더 많은 영세 창업 중소에 감면 적용 가능 (기획재정부, chungoose.kr)
중소기업 특별세액감면(§7) 일몰 2025.12.31. 2028.12.31.까지 3년 연장 2026.1.1. 이후 과세연도 감면 지속 가능 (국가법령정보센터, 기획재정부)
상생결제 세액공제 2025.12.31. 일몰 2028.12.31. 연장 현행 유지 (기획재정부)
대·중소 상생협력 기금 출연 공제 2025.12.31. 2028.12.31. 유지 (기획재정부)
벤처 투자(법인) 세액공제 적용·구조 종전 벤처목적회사(Vehicle)·민간재간접 통한 출자 인정 확대, 민간재간접 공제율 상향 법 개정 후 기업→벤처간 자금흐름 촉진 (법제처)
국제금융기구 원화표시 자산 투자소득 과세 비과세 신설 법 개정 후 외국인 원화자금 유치 (기획재정부)
영상콘텐츠 제작비 공제(§25의6) (기본) 5/10/15% + (추가) 10/10/15%(최대 15~30) 10%(중소 15%)로 조정 + 적용기한 2028.12.31. 2026 이후 발생 비용부터 공제 체계 단순화·수준 재조정 (혁신24 - 정부혁신 홈페이지, 국가법령정보센터, 기획재정부)
문화산업전문회사 출자 공제 중소·중견만 대기업까지 확대 법 개정 후 대형사 투자 유입 기대 (기획재정부)
웹툰 제작비 공제 부재 10%(중소 15%) 신설(’28.12.31.까지) 2026 이후 발생 비용 웹툰 산업 지원 (기획재정부)
스마트공장 설비 감가상각 특례 부재 손금산입 특례 신설 법 개정 후 중소 제조 CAPEX 절세 (기획재정부)
통합고용세액공제 기존 구조(감소 시 추징 등) 점증 구조로 개편·기한 ’28.12.31., 육아휴직 복귀자 추가공제 **’26.12.31.**까지 1년 연장 개정 후 고용 유지·증가 유인 강화 (기획재정부)
외국자회사 주식 현물출자(법인세) 이연 부재 과세이연 신설 법 개정 후 해외 구조조정 지원 (기획재정부)
고향사랑기부금(10~20만원 구간) 15% 40%(지방소득세 포함시 실효 44%) ’26.1.1. 이후 기부분 지역기부 유인↑ (기획재정부, 다음)
수도권 외 공장·본사 이전 감면 감면 2년 최대 5년, 대상·기간 확대·한도 신설(기한 ’28.12.31.) 개정 후 이전 인센티브↑ (기획재정부)
영농조합 등 농지 현물출자 양도세 감면 이월과세로 전환 개정 후 세부담 타이밍 조정 (기획재정부)
조합법인 과세특례(§72) 20억 초과분 12% 15%로 상향, 기한 ’28.12.31. 개정 후 일반법인과 형평성 제고 (국가법령정보센터, 기획재정부)
비과세 종합저축 65세 이상 노인 등 65세 이상은 ‘기초연금 수급대상’으로 한정, 기한 ’28.12.31.(일부는 ’26.1.1. 가입분부터 새 기준) 2026 이후 가입분 취약계층 집중 (PwC, 법제처)
조합 예탁·출자금 이자/배당 광범 적용 농·어민·임업인·저소득 조합원은 ’28.12.31. 가입분까지 비과세 연장, 그 외는 ’26.1.1.부터 저율 분리과세 2026~2028 과세형평·공정경쟁 (기획재정부)
PF 프로젝트리츠 현물출자 과세이연 (공모리츠·임대주택리츠 일부만 특례) 프로젝트리츠에 토지·건물 현물출자 시, 취득 주식 처분 시까지 양도세/법인세 이연 특례 신설(§97조의10 신설) 개정 후 PF 구조 선진화 (국가법령정보센터, 기획재정부)
월세 세액공제(맞벌이) 세대주만 별거 배우자 월세도 부부 합산(연 1,000만원 한도 내 추가 공제) 개정 후 주말부부 등 지원 (기획재정부)

■ 4. 각론 — 항목별 ‘핵심 포인트·적용시기·주의점’

4-1. 중소기업·벤처·디지털전환

  • 생계형 창업중소기업 기준 상향: 총수입 8천만→1억 400만원(부가세 간이과세 기준 정합화). 신규 창업의 감면 적용 저변 확대. 기획재정부chungoose.kr
  • 스마트공장 설비 손금산입 특례 신설: 감가상각 가속으로 현금흐름 개선 기대(세부 요건은 하위법령 예정). 기획재정부
  • 벤처 출자 세액공제 체계 보강: 벤처목적회사·민간재간접 경로 인정 확대·공제율 상향(민간재간접) 등으로 법인→벤처 투자 촉진. 법제처

4-2. 콘텐츠·문화산업

4-3. PF·리츠·부동산

  • 프로젝트리츠 현물출자 과세이연(신설): 내국인이 프로젝트리츠에 토지·건물을 현물출자시, 취득 주식 처분 때까지 양도세 납부/법인세 과세 이연. 종전에는 공모리츠/임대주택리츠 일부만 유사 특례 존재. 구조 재편·PF 안정화에 활용. 국가법령정보센터기획재정부

4-4. 고용·배당·환류

  • 통합고용세액공제 개편: 고용 감소시 추징에서 유지 시 2~3년차 가산으로 전환, 점증 구조 도입. 기한 **’28.12.31.**까지. 육아휴직 복귀자 추가공제 **’26.12.31.**까지 1년 연장. 기획재정부
  • 투자·상생협력 촉진세제: 환류대상에 배당 추가, 환류비율 상향, **’28.12.31.**까지 연장. 배당정책 변화 유도. 기획재정부
  • 고배당기업 배당소득 분리과세 도입: 요건 충족시 거주자 배당 **분리과세(14/20/35%)**로 전환. 종합세율(최대 45%) 대비 세부담 완화. 대한민국 정책브리핑

4-5. 지역균형·민생

  • 고향사랑기부금 공제율: 10~20만원 구간 15%→40%, ’26.1.1. 이후 기부부터. 지방소득세 포함 실효 최대 44%. 기획재정부다음
  • 수도권 외 공장·본사 이전: 감면기간 최대 5년, 대상지역/한도 정교화, **’28.12.31.**까지. 기획재정부
  • 월세 세액공제(맞벌이): 별거 배우자 월세 합산 허용(부부 합산 연 1,000만원 한도). 기획재정부

4-6. 저축·금융

  • 비과세 종합저축: 기한 ’28.12.31. 연장, 65세 이상은 ‘기초연금 수급대상자’로 한정(대상 정교화). ’26.1.1. 가입분부터 신규 제한 적용. PwC
  • 조합 예탁/출자금 과세체계: 농·어민·저소득 조합원은 ’28.12.31. 가입분까지 비과세 연장, 그 외는 ’26.1.1. 가입분부터 저율 분리과세. 기획재정부

4-7. 간접세(부가가치세·개소세 등) — 연장 패키지

온실가스배출권 면세, 전기·수소버스 부가세 면제, 행복기숙사 면제, 도서지방 자가발전 석유류 면제, 재활용폐자원·중고차 매입세액공제(중고차는 공제한도 신설) 등 대부분 2028.12.31.까지 연장. 기획재정부


■ 5. (건설·제조·콘텐츠·벤처) 실무 체크리스트

  • 건설/부동산·PF
    • 프로젝트리츠 활용 현물출자 → 과세이연 옵션 검토(자산 매각/지분전환 로드맵 재설계). 기존 공모/임대주택 리츠 특례와 혼동 금지. 국가법령정보센터
    • 지방 이전 검토 기업: 감면기간·한도 확대 반영해 IRR 재산정, 시행령 한도식 확인. 기획재정부
  • 제조·중소
    • 스마트공장 설비 투자는 손금산입 특례 요건에 맞춰 취득시기/감가연수 최적화. 기획재정부
    • 상생결제/특별감면 연장분 체크 → 연말 법인세 추정 업데이트. 기획재정부
  • 콘텐츠(방송·영화·웹툰)
  • 벤처 투자(법인)
    • 민간재간접 경로 공제율 상향 활용 → 내부 투자정책서·집행 라인 개정. 벤처목적회사(Vehicle) 통한 투자는 공제 인정 범위 확인. 법제처
  • 인사·세무
    • 통합고용세액공제 점증 구조 전환에 맞춰 채용·유지 전략 가중치 조정, 육아휴직 복귀자 관리 스케줄 반영. 기획재정부
    • 월세 공제 합산: 주말부부·별거 등 증빙(임대차·전입 등) 준비. 기획재정부

■ 6. 의견 제출 방법(템플릿 포함)

  • 온라인: 국민참여입법센터에서 해당 안건 검색 → 의견 등록(’25.08.14. 마감). NTS Call
  • 오프라인/이메일/팩스: 기재부 조세특례제도과 (044-215-4136), dongjun0@korea.kr, Fax 044-215-8063. 기획재정부

템플릿(요지)

  • (찬반) ○○조 ○항 ○호: 찬성/반대(사유: …)
  • (실무 영향) 우리 업종/기업에 비용·고용·투자 영향 분석 요약
  • (대안) 시행령/규칙 세부기준 제안(예: 한도/요건/서식 개선)

■ 7. 결론(3줄 요약)

  1. 연장·신설·조정이 광범위합니다: 중소·벤처·콘텐츠·지역균형·PF가 핵심 축.
  2. 변경 전/후를 정확히 파악해 투자·고용·이전·제작 타이밍을 재설계해야 합니다.
  3. 의견마감 8/14, 현장에서 필요한 하위법령(시행령·규칙) 세부 기준은 적극 제안하세요. 기획재정부

🔔 최신 이슈·동향(보너스)

  • 2025 세제개편안 공식 카드뉴스/상세본 공개: 고향사랑 40%, 고배당 분리과세, 지방이전 감면 확대, 웹툰 공제 신설 등 입법예고안과 일치. 세부 수치·사례는 카드뉴스/상세본으로 확인. 기획재정부+1

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